La chiesa dei Santi Pietro e Paolo fu eretta tra la fine del Cinquecento e l’inizio del Seicento, dopo che san Carlo Borromeo richiese di trasferire la sede parrocchiale dall’antica San Pietro in Campagna al centro dell’abitato. Dell’edificio originale, attribuito all’architetto Pellegrino Tibaldi, non rimane purtroppo traccia: nel 1836, in seguito all’istituzione del Vicariato di Luino, la chiesa fu infatti interamente ricostruita su progetto dell’architetto locale Natale Pugnetti.
All’interno, la cappella sinistra conserva statue seicentesche mentre l’altare maggiore in marmi policromi risale al Settecento. Sono qui custodite le spoglie di san Felicissimo martire, traslate a Luino dalla chiesa di San Fedele a Milano negli anni Trenta del Novecento, per ordine del cardinale Schuster. Pregevoli sono inoltre la pala con la Madonna del Carmine assieme ai santi Francesco e Giovanni Battista commissionata nel 1647 a Giovanni Battista Discepoli detto “lo zoppo di Lugano”, e i Quattro Evangelisti nei pennacchi della cupola, opere ottocentesche del pittore Raffaele Casnedi, originario di Runo e docente all’Accademia di Brera.