El llatzeret disposava del seu propi cementeri, on eren enterrades les restes dels que no aconseguien superar la malaltia després del període de quarantena. El mur que tanca la part nord oculta una zona reduïda que es va emprar per sepultar els no catòlics, un cementeri protestant que va tenir poc ús. Durant els 100 anys que el recinte va estar en actiu, el llatzeret va atendre gairebé 400.000 persones, de les quals van morir gairebé 400. La febre groga va ser la causa principal d’aquestes defuncions.